Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms