Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC016590.1-201ENST00000588763 420 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MAGED1-202ENST00000375695 2875 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 THUMPD3-206ENST00000452837 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TIGAR-204ENST00000635110 3633 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PLIN5-206ENST00000592610 1903 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLCO2B1-204ENST00000454962 3219 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DRC1-201ENST00000288710 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PTGER4P2-CDK2AP2P2-201ENST00000619442 3123 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ST3GAL5-254ENST00000640322 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MTHFSD-201ENST00000360900 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FETUB-201ENST00000265029 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SCNN1A-203ENST00000360168 3481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC144CP-201ENST00000340196 2823 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF627-201ENST00000361113 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TMEFF2-202ENST00000392314 2842 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 EIF3D-201ENST00000216190 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RASAL1-201ENST00000261729 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MIR9-3HG-203ENST00000546186 2718 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 C1RL-AS1-201ENST00000382215 2086 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CYP27C1-202ENST00000409327 2092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PCGF2-207ENST00000620225 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC6A12-201ENST00000359674 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms