Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 USP8-219ENST00000625664 1568 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 TMEM79-202ENST00000357501 975 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 COQ4-202ENST00000372875 928 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AL138885.2-201ENST00000420389 539 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AC000078.1-201ENST00000420617 682 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 LINC02151-201ENST00000452629 921 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 SMCR2-201ENST00000456090 564 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 IFI27L1-203ENST00000553664 647 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AC100788.1-201ENST00000591108 945 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 FAM69A-204ENST00000615519 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 IL4R-219ENST00000628578 201 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 SLC22A18AS-202ENST00000526203 664 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 GABARAPL2-203ENST00000565057 571 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 MED11-203ENST00000575284 652 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AL158032.2-201ENST00000616818 195 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AC073592.10-201ENST00000624789 597 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 GMPR2-205ENST00000456667 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 VWA3B-221ENST00000614454 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 CLDN10-AS1-201ENST00000416909 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AC116347.1-201ENST00000442824 720 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 SVILP1-203ENST00000450581 486 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AC005011.1-201ENST00000455206 210 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 ZFYVE1-206ENST00000555072 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 GGPS1-203ENST00000391855 1407 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 BTN2A2-204ENST00000432533 1570 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 OLFML1-204ENST00000530135 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 VOPP1-204ENST00000418904 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 VPS33A-202ENST00000451053 1154 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AC104117.1-201ENST00000517817 900 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms