Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC104759.1-201ENST00000559109 939 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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