Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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