Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TPTEP56180 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TPTEP56180 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TPTEP56180 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TPTEP56180 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TPTEP56180 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TPTEP56180 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TPTEP56180 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TPTEP56180 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TPTEP56180 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TPTEP56180 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TPTEP56180 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TPTEP56180 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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TPTEP56180 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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TPTEP56180 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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TPTEP56180 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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TPTEP56180 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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TPTEP56180 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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TPTEP56180 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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TPTEP56180 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TPTEP56180 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TPTEP56180 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TPTEP56180 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TPTEP56180 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TPTEP56180 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TPTEP56180 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TPTEP56180 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TPTEP56180 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TPTEP56180 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TPTEP56180 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TPTEP56180 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TPTEP56180 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TPTEP56180 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TPTEP56180 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TPTEP56180 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TPTEP56180 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TPTEP56180 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TPTEP56180 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TPTEP56180 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TPTEP56180 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TPTEP56180 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TPTEP56180 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TPTEP56180 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TPTEP56180 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TPTEP56180 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TPTEP56180 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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