Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 LINC01763-201ENST00000425185 1547 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 NDEL1-203ENST00000402554 1858 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 AHCYP7-201ENST00000560847 1308 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 FAM204A-202ENST00000369172 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 SRSF10-205ENST00000374452 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 TPT1-203ENST00000379056 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 APTX-203ENST00000379813 1121 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 AC064836.1-201ENST00000405197 704 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 APTX-220ENST00000476858 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 AC139795.1-201ENST00000499314 838 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 AC007992.1-201ENST00000513953 953 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 LINC02182-201ENST00000569362 498 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 ELP5-210ENST00000573657 687 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 snoZ6.3-201ENST00000583496 76 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NESP48681 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NESP48681 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NESP48681 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NESP48681 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NESP48681 AP000487.2-201ENST00000324630 394 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NESP48681 OBP2A-203ENST00000371776 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NESP48681 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NESP48681 AC010997.3-201ENST00000418818 502 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NESP48681 AC234582.2-201ENST00000455788 568 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NESP48681 AADAC-202ENST00000488869 719 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NESP48681 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NESP48681 TMEM161B-AS1-204ENST00000504636 1039 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NESP48681 AC008915.2-201ENST00000570080 730 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NESP48681 AC015563.2-201ENST00000579580 772 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NESP48681 OPN1MW-201ENST00000595290 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NESP48681 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NESP48681 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NESP48681 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NESP48681 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NESP48681 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NESP48681 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NESP48681 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NESP48681 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NESP48681 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 LINC00299-203ENST00000444688 537 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 AL583824.1-203ENST00000457948 761 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 SLC10A7-208ENST00000511374 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 AL391832.3-201ENST00000549744 846 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 PIGA-209ENST00000634582 965 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 HIST1H2APS4-202ENST00000635537 681 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 TTC39A-204ENST00000371750 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 FRG1-201ENST00000226798 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 LINC00618-201ENST00000435624 700 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 AC007255.1-202ENST00000447171 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 MIR2277-201ENST00000515916 93 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 RN7SL624P-201ENST00000580297 278 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NESP48681 AC023830.3-201ENST00000612995 1455 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NESP48681 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NESP48681 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NESP48681 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NESP48681 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NESP48681 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NESP48681 ZNF101-203ENST00000415784 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NESP48681 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NESP48681 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NESP48681 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NESP48681 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NESP48681 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NESP48681 CLUHP8-201ENST00000547527 1485 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NESP48681 OR6N1-201ENST00000335094 1027 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms