Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms