Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms