Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HPGDP15428 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms