Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ACADL-201ENST00000233710 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CYP27C1-202ENST00000409327 2092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms