Protein–RNA interactions for Protein: P06400

RB1, Retinoblastoma-associated protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1P06400 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RB1P06400 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RB1P06400 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RB1P06400 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RB1P06400 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RB1P06400 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RB1P06400 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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