Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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HOXA3O43365 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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HOXA3O43365 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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HOXA3O43365 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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HOXA3O43365 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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HOXA3O43365 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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