Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms