Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 NPIPP1-202ENST00000534799 1214 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 RANBP20P-201ENST00000557256 2104 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 NDUFAF6-202ENST00000396113 2549 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 PCDHGB2-201ENST00000522605 4602 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 AMACR-201ENST00000335606 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 ATP2A1-203ENST00000536376 3130 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 AC019294.1-202ENST00000566174 2071 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 ELP2-202ENST00000351393 2453 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COLCA2A8K830 IGSF9-202ENST00000368094 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 WASF3-201ENST00000335327 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 PDGFD-201ENST00000302251 4052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 EFHD1-204ENST00000410095 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 SLC2A4-201ENST00000317370 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ELN-201ENST00000252034 3781 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 CDC25B-201ENST00000245960 3597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 RECQL5-204ENST00000423245 3576 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 SLC22A14-202ENST00000448498 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 LRRCC1-201ENST00000360375 3813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 TNS2-210ENST00000549700 4525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ENPP5-201ENST00000230565 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 NFATC1-202ENST00000318065 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ACSF3-218ENST00000614302 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 HSH2D-206ENST00000613986 1957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 PLEKHG3-204ENST00000484731 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 CR2-202ENST00000367058 4063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AL355482.1-201ENST00000411509 2463 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ZNF773-205ENST00000599847 5832 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 JMJD7-PLA2G4B-201ENST00000342159 2966 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 SLC18A1-205ENST00000440926 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AC084855.2-201ENST00000559400 2393 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ZFP64-202ENST00000346617 2876 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 CYP4F12-201ENST00000324632 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms