Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms