Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST8

CEP89, Centrosomal protein of 89 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP89Q96ST8 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP89Q96ST8 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms