Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN4Q92575 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms