Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRN4Q8WUT4 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms