Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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ZNF397Q8NF99 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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ZNF397Q8NF99 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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ZNF397Q8NF99 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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ZNF397Q8NF99 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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