Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLIP4Q8N3C7 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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CLIP4Q8N3C7 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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CLIP4Q8N3C7 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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CLIP4Q8N3C7 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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CLIP4Q8N3C7 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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CLIP4Q8N3C7 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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CLIP4Q8N3C7 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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