Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4L6Q3SYB3 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms