Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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