Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 SERPIND1-202ENST00000406799 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 OR7E122P-201ENST00000383606 1017 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 CR769775.1-203ENST00000399894 579 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC012513.2-201ENST00000441511 1137 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC010677.1-201ENST00000441690 412 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC012100.1-201ENST00000470304 282 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC105424.1-201ENST00000514583 209 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 CAV2-202ENST00000343213 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 MRPL55-210ENST00000366736 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC093072.1-201ENST00000589196 602 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 CYP4F10P-201ENST00000589560 752 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AL109983.1-201ENST00000603234 646 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 OR52N1-201ENST00000317078 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 TAGLN2-201ENST00000320307 709 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 POLR3DP1-201ENST00000398689 1176 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AL391903.1-201ENST00000407513 365 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 SMUG1-213ENST00000506595 712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AL592146.2-201ENST00000565388 444 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AL161937.2-201ENST00000615503 403 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 ACKR1-202ENST00000368122 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 GSTM2P1-201ENST00000405166 654 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 SLC2A11-208ENST00000405847 730 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 ZNF589-202ENST00000412564 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 ROPN1L-AS1-201ENST00000513037 189 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 OSGIN1-206ENST00000565123 833 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AC009779.7-201ENST00000609031 469 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms