Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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FOXF1Q12946 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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FOXF1Q12946 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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FOXF1Q12946 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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FOXF1Q12946 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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FOXF1Q12946 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF1Q12946 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF1Q12946 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF1Q12946 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF1Q12946 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF1Q12946 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF1Q12946 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF1Q12946 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF1Q12946 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF1Q12946 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF1Q12946 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF1Q12946 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF1Q12946 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF1Q12946 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF1Q12946 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF1Q12946 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF1Q12946 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF1Q12946 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF1Q12946 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF1Q12946 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF1Q12946 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF1Q12946 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF1Q12946 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF1Q12946 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF1Q12946 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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