Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms