Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRB1P82279 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRB1P82279 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRB1P82279 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRB1P82279 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRB1P82279 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRB1P82279 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRB1P82279 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRB1P82279 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRB1P82279 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRB1P82279 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRB1P82279 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRB1P82279 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRB1P82279 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CRB1P82279 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRB1P82279 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRB1P82279 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRB1P82279 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRB1P82279 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms