Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP4P49662 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP4P49662 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP4P49662 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP4P49662 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP4P49662 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP4P49662 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP4P49662 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP4P49662 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP4P49662 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP4P49662 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP4P49662 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP4P49662 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP4P49662 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP4P49662 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP4P49662 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP4P49662 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP4P49662 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP4P49662 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP4P49662 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP4P49662 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP4P49662 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP4P49662 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASP4P49662 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASP4P49662 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASP4P49662 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASP4P49662 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASP4P49662 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASP4P49662 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASP4P49662 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASP4P49662 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms