Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRXP46100 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRXP46100 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRXP46100 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRXP46100 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRXP46100 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATRXP46100 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 KIR2DL1-201ENST00000291633 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 TCP10-205ENST00000476779 646 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AP000439.1-201ENST00000544004 581 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AL049871.1-201ENST00000557475 880 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 RN7SL460P-201ENST00000582806 258 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 SMIM17-201ENST00000598409 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AC010531.7-201ENST00000602665 465 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 DUSP22-206ENST00000603453 804 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 TPM3P7-201ENST00000338274 732 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 LINC02036-201ENST00000415869 910 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AC006001.3-205ENST00000428370 579 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AL356289.1-203ENST00000439795 789 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AC011389.2-201ENST00000514811 365 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 SLC16A7-209ENST00000549465 537 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATRXP46100 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ATRXP46100 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ATRXP46100 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ATRXP46100 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
ATRXP46100 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
ATRXP46100 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
ATRXP46100 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ATRXP46100 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 MIR100HG-219ENST00000533109 1794 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 RIPPLY2-201ENST00000369687 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 SWI5-204ENST00000419867 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AL138902.1-201ENST00000437965 856 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AC012066.1-201ENST00000439252 694 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AC020893.2-201ENST00000506083 723 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 MIR4689-201ENST00000582517 70 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AC011479.2-201ENST00000598146 432 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATRXP46100 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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