Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms