Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL512791.2-201ENST00000615251 4609 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SMAD9-201ENST00000350148 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SLC26A4-201ENST00000265715 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms