Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms