Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms