Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRC2Q9BYS8 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC2Q9BYS8 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms