Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms