Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms