Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC9Q8NEP7 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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