Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms