Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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TAF11Q15544 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF11Q15544 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF11Q15544 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF11Q15544 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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