Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 TEDDM2P-201ENST00000414169 786 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 CTLA4-203ENST00000427473 969 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 NR1I3-210ENST00000437437 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 TEX38-204ENST00000564373 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC025048.4-201ENST00000589740 699 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 ZNF674-AS1-202ENST00000609887 672 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 ZCCHC9-203ENST00000407610 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC005822.1-201ENST00000414124 1034 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AL358876.2-201ENST00000424689 477 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 VAMP2-203ENST00000481878 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 RN7SL452P-201ENST00000482923 291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 RN7SL477P-201ENST00000488440 286 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P55-201ENST00000505935 955 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC116914.2-201ENST00000571741 291 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 DSCR9-203ENST00000581640 472 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 FKBP4P1-201ENST00000507284 1347 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 GMEB1-201ENST00000294409 1912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 PSMB8-201ENST00000374881 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 OR2T33-201ENST00000318021 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC010136.1-201ENST00000450996 568 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 ALG10-202ENST00000538927 571 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AL645940.1-201ENST00000606432 594 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC005609.1-201ENST00000625195 617 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC025822.1-201ENST00000455525 633 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 RPL30P11-202ENST00000509114 358 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC044802.2-201ENST00000551187 434 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 INCA1-202ENST00000574617 1260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC116036.2-201ENST00000607592 462 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms