Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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