Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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