Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPTBN1Q01082 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms