Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PAX5-201ENST00000358127 8615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 LINC01973-201ENST00000374983 4678 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CNTNAP2-201ENST00000361727 9896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 OR1I1-202ENST00000641398 5984 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ATP2B2-202ENST00000360273 8962 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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