Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 TRIQK-219ENST00000523580 1630 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 MRPS16P3-201ENST00000415961 374 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AL157823.2-201ENST00000452048 669 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AP001979.1-201ENST00000529222 751 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 GSTM2P1-201ENST00000405166 654 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AL359915.1-201ENST00000457719 898 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 AP001979.2-201ENST00000526254 975 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 PXN-AS1-205ENST00000542314 707 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 RAB42P1-201ENST00000555078 316 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 SLC26A5-203ENST00000354356 2686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRCA2P51587 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCA2P51587 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRCA2P51587 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRCA2P51587 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCA2P51587 APOO-201ENST00000379226 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRCA2P51587 HBD-202ENST00000380299 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRCA2P51587 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCA2P51587 AC090825.2-201ENST00000557959 739 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BRCA2P51587 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRCA2P51587 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCA2P51587 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRCA2P51587 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCA2P51587 ZNF684-203ENST00000372699 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRCA2P51587 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCA2P51587 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRCA2P51587 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCA2P51587 IL6RP1-201ENST00000417848 1273 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BRCA2P51587 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BRCA2P51587 MT1L-201ENST00000565768 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRCA2P51587 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCA2P51587 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRCA2P51587 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRCA2P51587 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 CDCA7L-202ENST00000373934 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 AL352977.2-201ENST00000557101 547 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 ANXA13-201ENST00000262219 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 RBP1-201ENST00000232219 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 AC023590.1-202ENST00000366457 781 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 DHRSX-IT1-201ENST00000437244 651 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 674 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 AC027290.1-201ENST00000537827 484 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 RBP1-206ENST00000617459 667 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms