Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 SEPHS1P7-201ENST00000452995 1177 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 FGA-203ENST00000622532 1130 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms