Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MLH1P40692 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms