Protein–RNA interactions for Protein: P35968

KDR, Vascular endothelial growth factor receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDRP35968 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KDRP35968 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KDRP35968 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KDRP35968 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KDRP35968 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KDRP35968 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KDRP35968 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KDRP35968 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KDRP35968 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KDRP35968 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KDRP35968 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KDRP35968 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KDRP35968 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KDRP35968 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KDRP35968 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KDRP35968 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KDRP35968 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KDRP35968 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KDRP35968 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KDRP35968 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KDRP35968 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KDRP35968 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KDRP35968 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KDRP35968 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KDRP35968 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KDRP35968 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KDRP35968 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KDRP35968 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KDRP35968 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KDRP35968 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KDRP35968 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KDRP35968 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KDRP35968 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KDRP35968 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KDRP35968 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KDRP35968 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KDRP35968 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KDRP35968 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KDRP35968 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KDRP35968 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KDRP35968 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KDRP35968 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KDRP35968 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KDRP35968 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KDRP35968 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KDRP35968 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KDRP35968 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
KDRP35968 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
KDRP35968 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KDRP35968 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KDRP35968 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KDRP35968 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KDRP35968 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KDRP35968 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KDRP35968 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KDRP35968 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KDRP35968 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
KDRP35968 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KDRP35968 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KDRP35968 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KDRP35968 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KDRP35968 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KDRP35968 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KDRP35968 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KDRP35968 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KDRP35968 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDRP35968 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms