Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT9P35527 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT9P35527 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT9P35527 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT9P35527 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT9P35527 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT9P35527 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT9P35527 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms