Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RRBP1Q9P2E9 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms